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标记寡核苷酸的California Red和SunRed

 

      California Red和SunRed染料是美国AAT Bioquest生产的用于标记寡核苷酸的荧光染料。虽然磺酰罗丹明101酰氯(也称为TexasRed®)是磺酰氯中最常用的标记试剂,但它在水中非常不稳定,特别是在与脂族胺反应所需的较高pH值时。TexasRed®不加选择地与脂肪胺和芳香胺反应。此外,与染料琥珀酰亚胺酯相比,TexasRed®的标记效率极低。 California Red SE是一种琥珀酰亚胺酯。它是TexasRed®的绝佳替代品。   

      California Red 与胺类化合物(如氨基酸,寡核苷酸和蛋白质)发生反应,生成极其稳定的亮红色荧光结合物。与TexasRed®相比,California Red 具有更高的标记效率, California Red 的结合物具有与TexasRed®相同的激发和发射波长。研究表明,在相同的标签条件下,California Red 比TexasRed®更稳定。

      SunRed 具有比TexasRed®,TexasRed®-X和California Red 更好的水溶性。疏水性寡核苷酸与Texas Red的缀合物由于其水溶性差而难以用于测量生物活性测定。

 

California Red 和SunRed 的特性和优点

光谱特性几乎与TexasRed®相同
蛋白质上的荧光比TexasRed®更少淬灭
比TexasRed®更稳定
更高的共轭产率

 

图1.California Red 和TexasRed®偶联的光谱比较。(红色:TexasRed®;蓝色:California Red )

 

表1.California Red 和SunRed 与TexasRed®的比较

染料属性

California Red

SunRed

Texas Red®

最大吸收波长(nm)

595

595

594

最大荧光波长(nm)

615

615

613

消光系数(cm-1M-1)

100,000

100,000

100,000

纯度

单异构体

单异构体

3种异构体的混合物

反应组

琥珀酰亚胺酯

琥珀酰亚胺酯

磺酰氯

水溶解度(pH 7.0)

<1mg/ml

>10mg/ml

<1mg/ml

共轭产率(HPLC纯化后)

57%

56%

21%

 

表2.相关产品订购信息

货号

产品名称

规格

Ex (nm)

Em (nm)

EC (cm-1 M-1)

CF @260 nm

价格

473

核酸多肽蛋白标记 California Red SE

5 mg

583

603

100,000

0.456

1740

480

磺基罗丹明101磺酰氯

10 mg

588

601

100,000

0.456

1140

472

核酸多肽蛋白标记 SunRed SE

5 mg

583

603

100,000

0.484

1740

485

Texas Red 炔烃

5 mg

588

601

95,000

0.456

1740

484

Texas Red 叠氮化物

5 mg

588

601

95,000

0.456

1740

482

Texas Red 尸磺胺

5 mg

582

602

95,000

0.456

1740

481

Texas Red 酰肼

5 mg

582

602

95,000

0.456

1740

483

Texas Red 马来酰亚胺

5 mg

588

601

95,000

0.456

1140

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