标记寡核苷酸的California Red和SunRed
California Red和SunRed染料是美国AAT Bioquest生产的用于标记寡核苷酸的荧光染料。虽然磺酰罗丹明101酰氯(也称为TexasRed®)是磺酰氯中常用的标记试剂,但它在水中非常不稳定,特别是在与脂族胺反应所需的较高pH值时。TexasRed®不加选择地与脂肪胺和芳香胺反应。此外,与染料琥珀酰亚胺酯相比,TexasRed®的标记效率极低。 California Red SE是一种琥珀酰亚胺酯。它是TexasRed®的替代品。
California Red 与胺类化合物(如氨基酸,寡核苷酸和蛋白质)发生反应,生成极其稳定的亮红色荧光结合物。与TexasRed®相比,California Red 具有更高的标记效率, California Red 的结合物具有与TexasRed®相同的激发和发射波长。研究表明,在相同的标签条件下,California Red 比TexasRed®更稳定。
SunRed 具有比TexasRed®,TexasRed®-X和California Red 更好的水溶性。疏水性寡核苷酸与Texas Red的缀合物由于其水溶性差而难以用于测量生物活性测定。
California Red 和SunRed 的特性和优点
光谱特性几乎与TexasRed®相同蛋白质上的荧光比TexasRed®更少淬灭比TexasRed®更稳定更高的共轭产率
图1.California Red 和TexasRed®偶联的光谱比较。(红色:TexasRed®;蓝色:California Red )
表1.California Red 和SunRed 与TexasRed®的比较
染料属性 |
California Red |
SunRed |
Texas Red® |
大吸收波长(nm) |
595 |
595 |
594 |
大荧光波长(nm) |
615 |
615 |
613 |
消光系数(cm-1M-1) |
100,000 |
100,000 |
100,000 |
纯度 |
单异构体 |
单异构体 |
3种异构体的混合物 |
反应组 |
琥珀酰亚胺酯 |
琥珀酰亚胺酯 |
磺酰氯 |
水溶解度(pH 7.0) |
<1mg/ml |
>10mg/ml |
<1mg/ml |
共轭产率(HPLC纯化后) |
57% |
56% |
21% |
表2.相关产品订购信息
货号 |
产品名称 |
规格 |
Ex (nm) |
Em (nm) |
EC (cm-1 M-1) |
CF @260 nm |
价格 |
473 |
5 mg |
583 |
603 |
100,000 |
0.456 |
1740 |
|
480 |
10 mg |
588 |
601 |
100,000 |
0.456 |
1140 |
|
472 |
5 mg |
583 |
603 |
100,000 |
0.484 |
1740 |
|
485 |
5 mg |
588 |
601 |
95,000 |
0.456 |
1740 |
|
484 |
5 mg |
588 |
601 |
95,000 |
0.456 |
1740 |
|
482 |
5 mg |
582 |
602 |
95,000 |
0.456 |
1740 |
|
481 |
5 mg |
582 |
602 |
95,000 |
0.456 |
1740 |
|
483 |
5 mg |
588 |
601 |
95,000 |
0.456 |
1140 |
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