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标记寡核苷酸的花青染料

 

      花青染料是美国AAT Bioquest生产的一类经典染料。作为荧光染料,花青染料具有许多用途,特别是在生物医学成像中。 根据结构,它们覆盖光谱的可见光和近红外光谱部分。 Cy3®,Cy5®和Cy7®是最受欢迎的花青染料。 Cy3®具有橙色荧光(~550 / 570 nm),而Cy5®在红色区域(~650 / 670 nm)发荧光。 Cy3®和Cy5®通常组合用于双色检测。 它们通常在一个或两个氮侧链上与反应基团合成,因此它们可以与核酸或蛋白质分子化学连接。标记用于可视化和定量目的。Cy3®和Cy5®用于多种生物学应用,包括比较基因组杂交和基因芯片,用于转录组学。 它们还用于标记蛋白质和核酸,用于各种研究,包括蛋白质组学和RNA定位。

 

                                                                          图1.标记寡核苷酸的典型非磺化花青染料的化学结构          图2.标记寡核苷酸的磺化花青染料的化学结构

 

表1.花青染料的光谱比较

产品名称

Ex (nm)

Em (nm)

EC (cm-1 M-1)

Quantum Yield

Cy3®(磺化)

555

565

150,000

0.10

Cy3NS(非磺化)

549

565

145,000

0.07

Cy5®(磺化)

649

664

250,000

0.25

Cy5NS(非磺化)

644

665

230,000

0.16

Cy5.5®(磺化)

676

665

250,000

0.18

Cy5.5NS(非磺化)

675

697

230,000

Not Determined

Cy7®(磺化)

749

775

275,000

0.12

Cy7NS(非磺化)

750

780

250,000

0.02

 

表2.标记寡核苷酸的非磺化花青染料

货号

产品名称

规格

Ex(nm)

Em(nm)

EC(cm-1 M-1)

CF@260nm

价格

190

Cy3NS酸 CAS 1032678-01-5

100mg

549

565

145,000

0.033

4740

191

Cy3NS NHS酯

25mg

549

565

145,000

0.033

3540

194

Cy5NS 酸

100mg

644

665

230,000

0.088

4740

195

Cy5NS NHS酯

25mg

644

665

230,000

0.088

3540

197

Cy7NS 酸

100mg

750

780

250,000

0.053

4740

198

Cy7NS NHS酯

25mg

750

780

250,000

0.053

3540

181

吲哚菁绿ICG-ATT

1mg

780

800

240,000

0.114

4740

182

吲哚菁绿ICG-Osu

1mg

780

800

240,000

0.114

1740

180

吲哚菁绿ICG-Sulfo-Osu

1mg

780

800

240,000

0.114

3540

 

表3.标记寡核苷酸的磺化花青染料

货号

产品名称

规格

Ex (nm)

Em (nm)

EC(cm-1 M-1)

CF @260 nm

价格

141

Cy3 NHS酯

1 mg

555

565

150,000

0.042

1140

142

Cy3 马来酰亚胺

1 mg

555

565

150,000

0.042

2340

148

Cy3.5 NHS酯

1 mg

581

596

125,000

0.151

1140

149

Cy3.5 马来酰亚胺

1 mg

581

596

125,000

0.151

3540

151

Cy5 NHS酯

1 mg

649

665

250,000

0.026

1140

152

Cy5 马来酰亚胺

1 mg

649

665

250,000

0.026

2340

174

Cy5.5 NHS酯

1 mg

678

701

230,000

0.094

1140

177

Cy5.5 酰肼

1 mg

678

701

230,000

0.094

2940

161

Cy7 NHS酯

1 mg

749

776

275,000

0.025

1140

162

Cy7 马来酰亚胺

1 mg

749

776

275,000

0.025

2940

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