标记寡核苷酸的花青染料
花青染料是美国AAT Bioquest生产的一类经典染料。作为荧光染料,花青染料具有许多用途,特别是在生物医学成像中。 根据结构,它们覆盖光谱的可见光和近红外光谱部分。 Cy3®,Cy5®和Cy7®是受欢迎的花青染料。 Cy3®具有橙色荧光(~550 / 570 nm),而Cy5®在红色区域(~650 / 670 nm)发荧光。 Cy3®和Cy5®通常组合用于双色检测。 它们通常在一个或两个氮侧链上与反应基团合成,因此它们可以与核酸或蛋白质分子化学连接。标记用于可视化和定量目的。Cy3®和Cy5®用于多种生物学应用,包括比较基因组杂交和基因芯片,用于转录组学。 它们还用于标记蛋白质和核酸,用于各种研究,包括蛋白质组学和RNA定位。
图1.标记寡核苷酸的典型非磺化花青染料的化学结构 图2.标记寡核苷酸的磺化花青染料的化学结构
表1.花青染料的光谱比较
产品名称 |
Ex (nm) |
Em (nm) |
EC (cm-1 M-1) |
Quantum Yield |
Cy3®(磺化) |
555 |
565 |
150,000 |
0.10 |
Cy3NS(非磺化) |
549 |
565 |
145,000 |
0.07 |
Cy5®(磺化) |
649 |
664 |
250,000 |
0.25 |
Cy5NS(非磺化) |
644 |
665 |
230,000 |
0.16 |
Cy5.5®(磺化) |
676 |
665 |
250,000 |
0.18 |
Cy5.5NS(非磺化) |
675 |
697 |
230,000 |
Not Determined |
Cy7®(磺化) |
749 |
775 |
275,000 |
0.12 |
Cy7NS(非磺化) |
750 |
780 |
250,000 |
0.02 |
表2.标记寡核苷酸的非磺化花青染料
货号 |
产品名称 |
规格 |
Ex(nm) |
Em(nm) |
EC(cm-1 M-1) |
CF@260nm |
价格 |
190 |
100mg |
549 |
565 |
145,000 |
0.033 |
4740 |
|
191 |
25mg |
549 |
565 |
145,000 |
0.033 |
3540 |
|
194 |
100mg |
644 |
665 |
230,000 |
0.088 |
4740 |
|
195 |
25mg |
644 |
665 |
230,000 |
0.088 |
3540 |
|
197 |
100mg |
750 |
780 |
250,000 |
0.053 |
4740 |
|
198 |
25mg |
750 |
780 |
250,000 |
0.053 |
3540 |
|
181 |
1mg |
780 |
800 |
240,000 |
0.114 |
4740 |
|
182 |
1mg |
780 |
800 |
240,000 |
0.114 |
1740 |
|
180 |
1mg |
780 |
800 |
240,000 |
0.114 |
3540 |
表3.标记寡核苷酸的磺化花青染料
货号 |
产品名称 |
规格 |
Ex (nm) |
Em (nm) |
EC(cm-1 M-1) |
CF @260 nm |
价格 |
141 |
1 mg |
555 |
565 |
150,000 |
0.042 |
1140 |
|
142 |
1 mg |
555 |
565 |
150,000 |
0.042 |
2340 |
|
148 |
1 mg |
581 |
596 |
125,000 |
0.151 |
1140 |
|
149 |
1 mg |
581 |
596 |
125,000 |
0.151 |
3540 |
|
151 |
1 mg |
649 |
665 |
250,000 |
0.026 |
1140 |
|
152 |
1 mg |
649 |
665 |
250,000 |
0.026 |
2340 |
|
174 |
1 mg |
678 |
701 |
230,000 |
0.094 |
1140 |
|
177 |
1 mg |
678 |
701 |
230,000 |
0.094 |
2940 |
|
161 |
1 mg |
749 |
776 |
275,000 |
0.025 |
1140 |
|
162 |
1 mg |
749 |
776 |
275,000 |
0.025 |
2940 |
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