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标记寡核苷酸的罗丹明染料

English title: Rhodamine:Fluorescent Oligonucleotide Labeling Reagents

 

        罗丹明染料是美国AAT Bioquest生产的一类用于标记寡核苷酸的荧光染料。罗丹明染料是荧光素的补充剂,因为它们提供更长波长的发射大值,并为多色标记和染色提供了机会。 罗丹明的光稳定性高于荧光素和香豆素。 羧基四甲基罗丹明(TAMRA)是用于制备寡核苷酸缀合物的常见荧光团。 磺酰罗丹明101磺胺氯化物(TexasRed®)是另一种流行的寡核苷酸标记染料。 然而,TexasRed®不稳定,与其他羧基罗丹明染料(如5-TAMRA,SE)相比,其偶联产率低得多。

        AAT Bioquest研发了California Red 取代了TexasRed®。 California Red 具有与TexasRed®几乎相同的光谱特性和类似的水溶性。 California Red 更稳定,并且比TexasRed®具有更高的共轭产率。

图1.用于标记寡核苷酸的典型罗丹明染料的化学结构

 

表2.用于标记寡核苷酸的罗丹明染料

货号

产品名称

规格

Ex (nm)

Em (nm)

EC (cm-1 M-1)

CF @260 nm

价格

479

核酸多肽蛋白标记 California Red SE

1 mg

583

603

100,000

0.456

1140

473

核酸多肽蛋白标记 California Red SE

5mg

583

603

100,000

0.456

1740

470

丽丝胺碱性蕊香红B磺酰氯 CAS 62796-29-6

100 mg

568

583

85,000

0.288

1140

380

5(6)-ROX 5(6)-羧基-X-罗丹明 CAS 198978-94-8

100 mg

568

591

85,000

0.301

5940

390

5(6)-ROX, SE 5(6)-羧基-X-罗丹明琥珀酰亚胺酯

25 mg

576

601

93,000

0.301

2340

495

6-ROX 6-羧基-X-罗丹明炔烃

5 mg

575

602

95,000

0.307

1740

494

6-ROX 6-羧基-X-罗丹明叠氮化物

5 mg

575

602

95,000

0.307

1740

426

6-ROX 6-羧基-C2-罗丹明马来酰亚胺

1 mg

575

602

95,000

0.307

1140

392

6-ROX, SE 6-羧基-X-罗丹明琥珀酰亚胺酯 CAS 216699-36-4

5 mg

575

602

95,000

0.307

1140

480

磺基罗丹明101磺酰氯

10 mg

588

601

100,000

0.456

1140

370

5(6)-TAMRA, SE 5(6)-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯 CAS 246256-50-8

25 mg

546

575

75,000

0.320

1140

423

5(6)-TAMRA C6 马来酰亚胺

5 mg

544

575

75,000

0.320

1140

491

6-TAMRA 6-羧基四甲基罗丹明炔烃

5 mg

547

573

75,000

0.335

1740

490

6-TAMRA 6-羧基四甲基罗丹明叠氮化物

5 mg

547

573

75,000

0.335

1740

425

6-TAMRA 6羧基四甲基罗丹明-C6-马来酰亚胺

5 mg

544

575

75,000

0.335

2340

357

6-羧基四甲基罗丹明尸胺 6-TAMRA cadaverine

5 mg

544

575

75,000

0.335

3540

6051

6-TAMRA 6-羧基四甲基罗丹明 CPG*1000 Å*

1 g

546

578

75,000

0.335

5940

359

6-羧基四甲基罗丹明乙二胺 6-TAMRA ethylenediamine

5 mg

544

575

75,000

0.335

2340

419

6-TAMRA 6羧基四甲基罗丹明马来酰亚胺 CAS 174568-68-4

1 mg

540

567

75,000

0.335

2340

376

6-TAMRA, SE 6-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯 CAS 150810-69-8

5 mg

547

573

78,000

0.335

1188

485

Texas Red 炔烃

5 mg

588

601

95,000

0.456

1740

484

Texas Red 叠氮化物

5 mg

588

601

95,000

0.456

1740

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