Cy3亚磷酰胺单体
英文名称：Cy3 phosphoramidite
产品参数
| Ex (nm) | 555 | Em (nm) | 569 |
| 分子量 | 953.63 | 溶剂 | MeCN |
| 存储条件 | 在零下15度以下保存, 避免光照 |
产品概述
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产品介绍
两种花菁衍生物——Cy3和Cy5亚磷酰胺——是制备荧光标记寡核苷酸中最常用的荧光标记试剂。花菁染料通常在5'末端引入一次，且其中的MMT保护基需在合成仪上直接去除。MMT阳离子（黄色）与DMT阳离子（橙色）的吸收特征存在显著差异，因此可通过监测三苯甲基吸收值来跟踪寡核苷酸的偶联效率。
花菁染料亚磷酰胺同样可成功应用于3'末端相邻位点的标记。对于含花菁染料的寡核苷酸去保护操作，无论所用单体是否带有碱基保护基，均可采用室温氨水处理。若需使用加热的氨水进行去保护，Cy3和Cy3.5染料比Cy5和Cy5.5具有更好的稳定性。但为稳妥起见，建议选用带有碱基不稳定保护基的单体，并将65°C条件下的去保护时间控制在2小时以内。
通用储备液配制
表1. 为将特定质量的Cy3亚磷酰胺配制至指定浓度所需乙腈体积。请注意，该体积仅用于配制储备液。具体实验/生理缓冲液的选择请参考实验方案示例。
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0.1 mg
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0.5 mg
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1 mg
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5 mg
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10 mg
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1 mM
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104.862 µL
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524.312 µL
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1.049 mL
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5.243 mL
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10.486 mL
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5 mM
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20.972 µL
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104.862 µL
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209.725 µL
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1.049 mL
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2.097 mL
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10 mM
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10.486 µL
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52.431 µL
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104.862 µL
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524.312 µL
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1.049 mL
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