百萤推荐:检测冠状病毒SARS-CoV-2的系列产品
本周,百萤生物为大家推荐的是AAT Bioquest研发的可用于SARS-CoV-2的产品。什么是SARS-CoV-2?什么是COVID-19?它的组成结构是什么?它的病原体检测方案有哪些?感兴趣的小伙伴一起来看看吧!
COVID-19简介
冠状病毒病2019(COVID-19)是由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的传染病。它最初于2019年12月在中国武汉被发现,截止现在,COVID-19已感染185个国家的260万人,导致超过200,000人死亡(截至2020年4月26日)。虽然大多数感染的患者会出现以发烧,咳嗽和呼吸急促为特征的轻度症状,但这种疾病会发展成致命的肺炎和急性呼吸衰竭,对免疫力逐渐降低的老年人有很大的感染率。
SARS-CoV-2结构:RNA和蛋白质成分
SARS-CoV-2的结构成分由以下组成:刺突蛋白,膜糖蛋白,包膜蛋白,核衣壳蛋白和RNA。下表概述了每个组件的功能。
SARS-CoV-2组成 | 功能 |
刺突蛋白 | 刺突蛋白(S蛋白)是大型的,高度糖基化的跨膜蛋白,在病毒表面形成独特的冠状外观。S蛋白的胞外域由N端和C端域组成,分别称为S1和S2亚基。含有受体结合结构域的S1亚基负责识别并与宿主细胞受体结合。S2亚基包含一个融合肽和两个七肽重复序列(HR1和HR2),负责病毒细胞膜融合。从治疗的角度来看,S蛋白是SARS-CoV-2疫苗和能够阻止病毒结合和融合的疗法(例如抗体)的抗病毒研发靶标。 |
膜蛋白 | 膜蛋白(M蛋白)是所有结构蛋白中最丰富的,它们定义了病毒包膜的形状。M蛋白被认为是SARS-CoV-2的主要配位体,因为它与所有主要的冠状病毒结构蛋白相互作用。M蛋白与S蛋白的相互作用促进了S蛋白在ER-高尔基体中的保留并整合到新的病毒体中。M蛋白和N蛋白相互作用可稳定核衣壳并促进病毒加载的完成。M蛋白和E蛋白相互作用形成病毒包膜,其有助于病毒样颗粒的产生和释放。 |
包膜蛋白 | 包膜蛋白(E蛋白)是结构蛋白中最小的。它们对于病毒的产生和成熟至关重要,并有助于病毒的释放。一小部分E蛋白被整合到病毒粒子包膜中,而大多数则位于细胞内运输的部位(例如ER-高尔基体)。 |
核衣壳蛋白 | 高度磷酸化的核衣壳蛋白(N蛋白)主要功能是结合SARS-CoV-2 RNA基因组并将其封装在病毒包膜内,形成核糖核衣壳复合物。该衣壳对于病毒自加载和复制至关重要。N蛋白也影响宿主细胞对病毒感染的反应。 |
RNA基因组 | RNA是病毒的基因组。一旦SARS-CoV-2进入宿主细胞,它就会复制基因组RNA以产生更小的亚基因组RNA片段。这些片段用于合成病毒感染所必需的蛋白质(例如S,M,N和E蛋白)。 |
用于病毒研究的研究方案
拥有正确的实验试剂对于加快COVID-19和SARS-CoV-2的科学研究至关重要。从用于病毒表征和疫苗开发的基因组工具,到用于快速诊断试剂盒开发的免疫分析实验,百萤为您提供了全面的实验方案来推动您的研究。
通过Sanger测序发现病毒基因组
表1.用于Sanger测序的MagaDye ddNTP产品。
产品名称 | 核苷酸 | Ex(nm) | Em(nm) | Abs(nm) | 规格 | 货号 |
MagaDye 535-ddGTP | 鸟嘌呤 | 503nm | 536nm | 503nm | 5 nmoles | 17063 |
50 nmoles | 17067 | |||||
MagaDye 561-ddATP | 腺嘌呤 | 498nm | 561nm | 498nm | 5 nmoles | 17062 |
50 nmoles | 17066 | |||||
MagaDye 588-ddTTP | 胸腺嘧啶 | 498nm | 588nm | 498nm | 5 nmoles | 17061 |
50 nmoles | 17065 | |||||
MagaDye 613-ddCTP | 胞嘧啶 | 498nm | 614nm | 498nm | 5 nmoles | 17060 |
50 nmoles | 17064 |
表2.MagaDye 4色 Sanger测序终止试剂盒。
产品名称 | ddNTPs | Ex(nm) | Em(nm) | Abs(nm) | 规格 | 货号 |
MagaDye 4色Sanger测序终止试剂盒 | ddGTP ddATP ddTTP ddCTP |
488nm | 536 nm 561 nm 588 nm 614 nm |
498nm | 5 nmoles | 17068 |
COVID-19病原体检测的研究方案
通过RT-PCR进行核酸分析和血清检测是广泛用于检测SARS-CoV-2的两种技术。RT-PCR是应用最广泛的平台,建议用于SARS-CoV-2早期感染的筛查或诊断。RT-PCR可以在血清转化之前检测病毒RNA的存在,血清转化是针对病原体并在血液中可检测到的特异性抗体的时间段。如酶联免疫吸附测定(ELISA)和侧向流动免疫测定(LFIA)之类的血清检测可检测血清中是否存在对病毒感染产生的抗体。
RNA定量和PCR试剂
产品名称 | Ex(nm) | Em(nm) | 规格 | 货号 |
StrandBrite 绿色荧光RNA定量试剂盒*高选择性* | 490nm | 540nm | 100 Tests | 17657 |
StrandBrite 绿色RNA定量试剂 | 490nm | 525nm | 1ml | 17610 |
10ml | 17611 | |||
Portelite 荧光RNA定量试剂盒 | 490nm | 525nm | 100 Tests | 17658 |
500 Tests | 17659 | |||
Cyber Green [相当于SYBR®Green] * 20X水性PCR溶液* | 498nm | 522nm | 5 x 1 mL Tests | 17591 |
1ml | 17592 | |||
Cyber Green 核酸凝胶染料[相当于SYBR®Green] | 498nm | 522nm | 100ul | 17604 |
1ml | 17590 |
疫苗开发的研究方案
蛋白酶在蛋白质激活、细胞调节和细胞信号转导中以及在氨基酸合成中的蛋白质合成或在其他代谢途径中的利用中起着至关重要的作用。抑制多蛋白蛋白水解加工所必需的病毒蛋白酶已分别是治疗人类免疫缺陷病毒(HIV)和丙型肝炎的成功策略,证明蛋白酶抑制剂可用于治疗病毒感染。同样,SARS-CoV-2的主要蛋白酶(M pro或3 CL pro)被认为对病毒基因表达和复制至关重要,因此被认为是抗CoV药物设计的主要目标。
Covidyte COVID-19肽底物
产品名称 | 序列长度 | Ex(nm) | Em(nm) | ε¹ | 规格 | 货号 |
Covidyte EN450 | 14个氨基酸 | 336nm | 455nm | 5900 | 100 Tests | 13535 |
1000 Tests | 13536 | |||||
Covidyte ED450 | 11个氨基酸 | 336nm | 455nm | 5900 | 100 Tests | 13537 |
1000 Tests | 13538 | |||||
Covidyte TF670 | 14个氨基酸 | 649nm | 664nm | 250,000 | 100 Tests | 13540 |
1000 Tests | 13541 | |||||
Covidyte IF670 | 11个氨基酸 | 656nm | 670nm | 250,000 | 100 Tests | 13542 |
1000 Tests | 13543 |
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